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稻屬最全超級泛基因組圖譜問世

今日都市網(wǎng) 2024-11-25 0.14w
原標(biāo)題:稻屬最全超級泛基因組圖譜問世

日前,國際學(xué)術(shù)期刊《自然·通訊》在線刊發(fā)江西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院原院長顏龍安院士團隊聯(lián)合河北大學(xué)杜會龍教授團隊的研究成果:首個稻屬最全超級泛基因組圖譜繪制成功。

泛基因組是一個物種中所有個體基因組信息的總和,構(gòu)建泛基因組可以有效解決單一參考基因組帶來的遺傳信息分析偏差。超級泛基因組代表一個屬內(nèi)所有物種的基因組信息,尤其蘊含了野生種中豐富的基因組變異,是對泛基因組的進一步擴展,在遠緣雜交和基因發(fā)掘等方向具有重要應(yīng)用前景。稻屬隸屬于禾本科的稻亞科,包括2個栽培稻種和21個野生稻種。其中,野生稻為栽培稻近緣物種,是現(xiàn)代水稻品種遺傳改良和種質(zhì)創(chuàng)新的基因?qū)殠?,具有重要的挖掘價值。

研究團隊組裝了稻屬13個近乎完美的野生稻種的基因組,并結(jié)合已公開的普通野生稻、亞洲栽培稻和非洲栽培稻基因組,構(gòu)建了包含101723個基因家族的稻屬超級泛基因組。其中,稻屬共有的核心基因家族僅占9.84%,共鑒定到63881個栽培稻中尚未發(fā)現(xiàn)的新基因家族,使可利用的水稻基因擴大了1.7倍。同時,基于高質(zhì)量的基因組圖譜,首次在基因組水平重構(gòu)了稻屬的進化關(guān)系。

該研究構(gòu)建的稻屬超級泛基因組極大地擴展了水稻遺傳改良的基因池,對野生稻種質(zhì)創(chuàng)新利用具有重要理論意義和應(yīng)用價值,同時為稻屬進化和馴化研究提供新的見解。(據(jù)權(quán)威消息了解王洋、李玉蘭、胡曉軍)

編輯:金杜

圖譜 基因 超級

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